MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 plasmid pESA2

Total Repeats: 510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009779	CG	3	6	411	416	0 %	0 %	50 %	50 %	156936508
2	NC_009779	GC	3	6	419	424	0 %	0 %	50 %	50 %	156936508
3	NC_009779	G	6	6	558	563	0 %	0 %	100 %	0 %	156936508
4	NC_009779	GAC	2	6	566	571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936508
5	NC_009779	CGC	2	6	682	687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936508
6	NC_009779	GAGG	2	8	886	893	25 %	0 %	75 %	0 %	156936509
7	NC_009779	A	6	6	898	903	100 %	0 %	0 %	0 %	156936509
8	NC_009779	TCT	3	9	942	950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936509
9	NC_009779	ACC	2	6	1122	1127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936509
10	NC_009779	GAT	2	6	1138	1143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936509
11	NC_009779	GAAA	2	8	1160	1167	75 %	0 %	25 %	0 %	156936509
12	NC_009779	TGC	2	6	1200	1205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936509
13	NC_009779	ACC	2	6	1281	1286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936509
14	NC_009779	AT	3	6	1291	1296	50 %	50 %	0 %	0 %	156936509
15	NC_009779	TTC	2	6	1374	1379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936509
16	NC_009779	TTA	2	6	1394	1399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936509
17	NC_009779	TTG	2	6	1413	1418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936509
18	NC_009779	GAA	2	6	1559	1564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936509
19	NC_009779	A	6	6	1592	1597	100 %	0 %	0 %	0 %	156936509
20	NC_009779	GCA	2	6	1637	1642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936509
21	NC_009779	ATTT	2	8	1686	1693	25 %	75 %	0 %	0 %	156936509
22	NC_009779	GGA	2	6	1717	1722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936509
23	NC_009779	AGA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936509
24	NC_009779	TC	3	6	1794	1799	0 %	50 %	0 %	50 %	156936509
25	NC_009779	GCT	2	6	1824	1829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936509
26	NC_009779	ATT	2	6	1835	1840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936509
27	NC_009779	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936509
28	NC_009779	TGA	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936509
29	NC_009779	ATC	2	6	1974	1979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936509
30	NC_009779	TC	3	6	1978	1983	0 %	50 %	0 %	50 %	156936509
31	NC_009779	AT	3	6	2031	2036	50 %	50 %	0 %	0 %	156936509
32	NC_009779	CAG	2	6	2163	2168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936509
33	NC_009779	TTG	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936509
34	NC_009779	ATG	2	6	2205	2210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936509
35	NC_009779	AT	3	6	2232	2237	50 %	50 %	0 %	0 %	156936509
36	NC_009779	GAT	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936509
37	NC_009779	AGGC	2	8	2273	2280	25 %	0 %	50 %	25 %	156936509
38	NC_009779	TGC	2	6	2307	2312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936509
39	NC_009779	CA	3	6	2344	2349	50 %	0 %	0 %	50 %	156936509
40	NC_009779	CCA	2	6	2367	2372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936509
41	NC_009779	CTT	2	6	2411	2416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936509
42	NC_009779	GCCT	2	8	2440	2447	0 %	25 %	25 %	50 %	156936509
43	NC_009779	A	7	7	2491	2497	100 %	0 %	0 %	0 %	156936510
44	NC_009779	GAAA	2	8	2518	2525	75 %	0 %	25 %	0 %	156936510
45	NC_009779	A	7	7	2523	2529	100 %	0 %	0 %	0 %	156936510
46	NC_009779	TCT	2	6	2553	2558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936510
47	NC_009779	AGG	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936510
48	NC_009779	CA	3	6	2630	2635	50 %	0 %	0 %	50 %	156936510
49	NC_009779	TA	3	6	2642	2647	50 %	50 %	0 %	0 %	156936510
50	NC_009779	A	6	6	2711	2716	100 %	0 %	0 %	0 %	156936510
51	NC_009779	CTG	2	6	2762	2767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936510
52	NC_009779	GAA	2	6	2877	2882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936510
53	NC_009779	ATT	2	6	2950	2955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936510
54	NC_009779	TGT	2	6	2973	2978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936510
55	NC_009779	CT	3	6	2997	3002	0 %	50 %	0 %	50 %	156936510
56	NC_009779	ACATCA	2	12	3020	3031	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	156936510
57	NC_009779	GCC	2	6	3046	3051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936510
58	NC_009779	GTC	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936510
59	NC_009779	GAA	2	6	3214	3219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936510
60	NC_009779	GCA	2	6	3293	3298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936511
61	NC_009779	TGAT	2	8	3372	3379	25 %	50 %	25 %	0 %	156936511
62	NC_009779	AAAGC	2	10	3473	3482	60 %	0 %	20 %	20 %	156936511
63	NC_009779	GCTG	2	8	3552	3559	0 %	25 %	50 %	25 %	156936511
64	NC_009779	TGA	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936511
65	NC_009779	AGG	2	6	3675	3680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936511
66	NC_009779	CAAC	2	8	3742	3749	50 %	0 %	0 %	50 %	156936511
67	NC_009779	GGC	2	6	3924	3929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936512
68	NC_009779	ATC	2	6	4048	4053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936512
69	NC_009779	GCT	2	6	4056	4061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936512
70	NC_009779	TGG	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936512
71	NC_009779	AG	3	6	4118	4123	50 %	0 %	50 %	0 %	156936512
72	NC_009779	GAA	2	6	4131	4136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936512
73	NC_009779	GCA	2	6	4264	4269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936513
74	NC_009779	CT	3	6	4281	4286	0 %	50 %	0 %	50 %	156936513
75	NC_009779	AT	3	6	4303	4308	50 %	50 %	0 %	0 %	156936513
76	NC_009779	CGGGT	2	10	4345	4354	0 %	20 %	60 %	20 %	156936513
77	NC_009779	CTG	2	6	4374	4379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936513
78	NC_009779	TCA	2	6	4517	4522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936514
79	NC_009779	CTGA	2	8	4582	4589	25 %	25 %	25 %	25 %	156936514
80	NC_009779	TCACTC	2	12	4667	4678	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	156936514
81	NC_009779	ACC	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936514
82	NC_009779	GTC	2	6	4748	4753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936514
83	NC_009779	ATC	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936514
84	NC_009779	CAG	2	6	4798	4803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936514
85	NC_009779	CAA	2	6	4806	4811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936514
86	NC_009779	AGT	2	6	4826	4831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936514
87	NC_009779	TGG	2	6	4836	4841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936514
88	NC_009779	TGC	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936514
89	NC_009779	CGG	2	6	4936	4941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936514
90	NC_009779	CG	3	6	5053	5058	0 %	0 %	50 %	50 %	156936514
91	NC_009779	TTA	2	6	5628	5633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936515
92	NC_009779	GAG	2	6	5668	5673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936515
93	NC_009779	ACC	2	6	5789	5794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936515
94	NC_009779	ATT	2	6	5805	5810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936515
95	NC_009779	AC	3	6	5831	5836	50 %	0 %	0 %	50 %	156936515
96	NC_009779	TA	3	6	5887	5892	50 %	50 %	0 %	0 %	156936515
97	NC_009779	TTA	2	6	5913	5918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936515
98	NC_009779	CAG	2	6	5938	5943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936515
99	NC_009779	TTG	2	6	5944	5949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936515
100	NC_009779	ATT	2	6	5954	5959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936515
101	NC_009779	GTA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936515
102	NC_009779	C	7	7	6132	6138	0 %	0 %	0 %	100 %	156936515
103	NC_009779	CT	3	6	6184	6189	0 %	50 %	0 %	50 %	156936515
104	NC_009779	CCG	2	6	6190	6195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936515
105	NC_009779	CCG	2	6	6201	6206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936515
106	NC_009779	TCA	2	6	6225	6230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936515
107	NC_009779	GCA	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936515
108	NC_009779	GCA	3	9	6402	6410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936515
109	NC_009779	TGC	2	6	6416	6421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936515
110	NC_009779	TCA	2	6	6432	6437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936515
111	NC_009779	CGT	2	6	6781	6786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936516
112	NC_009779	C	6	6	6838	6843	0 %	0 %	0 %	100 %	156936516
113	NC_009779	T	6	6	7078	7083	0 %	100 %	0 %	0 %	156936516
114	NC_009779	AAC	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936516
115	NC_009779	ATG	2	6	7180	7185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936516
116	NC_009779	CAC	2	6	7292	7297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936516
117	NC_009779	TCAA	2	8	7327	7334	50 %	25 %	0 %	25 %	156936516
118	NC_009779	GAAAC	2	10	7357	7366	60 %	0 %	20 %	20 %	156936516
119	NC_009779	CCG	2	6	7450	7455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936516
120	NC_009779	C	6	6	7472	7477	0 %	0 %	0 %	100 %	156936516
121	NC_009779	GA	3	6	7586	7591	50 %	0 %	50 %	0 %	156936516
122	NC_009779	CT	3	6	7623	7628	0 %	50 %	0 %	50 %	156936516
123	NC_009779	CGAG	2	8	7667	7674	25 %	0 %	50 %	25 %	156936516
124	NC_009779	AGC	2	6	7689	7694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936516
125	NC_009779	GAATT	2	10	7708	7717	40 %	40 %	20 %	0 %	156936516
126	NC_009779	GCGT	2	8	8543	8550	0 %	25 %	50 %	25 %	156936517
127	NC_009779	GGC	2	6	8615	8620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936517
128	NC_009779	CAG	2	6	8632	8637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936517
129	NC_009779	CTT	2	6	8638	8643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936517
130	NC_009779	GCC	2	6	8683	8688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936517
131	NC_009779	GCT	2	6	8700	8705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936517
132	NC_009779	GAA	3	9	8782	8790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936517
133	NC_009779	GACC	2	8	8887	8894	25 %	0 %	25 %	50 %	156936517
134	NC_009779	GAC	2	6	8917	8922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936517
135	NC_009779	GCA	2	6	8940	8945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936517
136	NC_009779	CG	3	6	9075	9080	0 %	0 %	50 %	50 %	156936517
137	NC_009779	CTT	2	6	9143	9148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936518
138	NC_009779	TGGCGT	2	12	9164	9175	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	156936518
139	NC_009779	CG	3	6	9206	9211	0 %	0 %	50 %	50 %	156936518
140	NC_009779	TCC	2	6	9226	9231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936518
141	NC_009779	CAG	2	6	9270	9275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936518
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144	NC_009779	CGA	2	6	9311	9316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936518
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149	NC_009779	CGG	2	6	9604	9609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936519
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161	NC_009779	CCG	2	6	10041	10046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936520
162	NC_009779	GGC	2	6	10048	10053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936520
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244	NC_009779	AGGCG	2	10	14371	14380	20 %	0 %	60 %	20 %	156936524
245	NC_009779	TTC	2	6	14405	14410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936524
246	NC_009779	AGC	3	9	14445	14453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936524
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249	NC_009779	GCA	2	6	14634	14639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936524
250	NC_009779	AG	3	6	14802	14807	50 %	0 %	50 %	0 %	156936525
251	NC_009779	GC	3	6	14837	14842	0 %	0 %	50 %	50 %	156936525
252	NC_009779	GAT	2	6	14895	14900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936525
253	NC_009779	T	6	6	14941	14946	0 %	100 %	0 %	0 %	156936525
254	NC_009779	C	6	6	15009	15014	0 %	0 %	0 %	100 %	156936525
255	NC_009779	A	6	6	15153	15158	100 %	0 %	0 %	0 %	156936525
256	NC_009779	GAT	2	6	15503	15508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936526
257	NC_009779	GC	3	6	15532	15537	0 %	0 %	50 %	50 %	156936526
258	NC_009779	GGC	2	6	15626	15631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936526
259	NC_009779	CTT	2	6	15717	15722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936526
260	NC_009779	CGG	2	6	15819	15824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936526
261	NC_009779	TG	3	6	15863	15868	0 %	50 %	50 %	0 %	156936526
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